Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXD3Q9UJU5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms