Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP86

CABP5, Calcium-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP5Q9NP86 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CABP5Q9NP86 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CABP5Q9NP86 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms