Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLK3Q9C098 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLK3Q9C098 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms