Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF1Q9BXJ1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF1Q9BXJ1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms