Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms