Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf3Q8WVX3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms