Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CKAP2LQ8IYA6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms