Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 CADM1-207ENST00000537140 1646 ntTSL 1 (best)19.65■□□□□ 0.742e-11■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.692e-11■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.252e-11■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 CADM1-218ENST00000545380 2373 ntTSL 1 (best)15.84■□□□□ 0.132e-11■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 CADM1-220ENST00000546000 734 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -02e-11■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 CADM1-219ENST00000545960 630 ntTSL 514.36□□□□□ -0.112e-11■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 CADM1-209ENST00000540852 476 ntTSL 213.8□□□□□ -0.22e-11■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.252e-11■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.342e-11■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 CADM1-212ENST00000542447 4223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.552e-11■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 CADM1-215ENST00000543375 668 ntTSL 311.2□□□□□ -0.622e-11■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.672e-11■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 CADM1-203ENST00000452722 8588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.942e-11■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 AGAP3-207ENST00000467724 826 ntTSL 516.66■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 DYNC1LI2-215ENST00000570201 292 ntTSL 33.14□□□□□ -1.917e-27■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 RFXANK-204ENST00000421262 856 ntTSL 522.55■■□□□ 1.28e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.138e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 P2RX4-212ENST00000543318 1429 ntTSL 1 (best)21.59■■□□□ 1.058e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 DEK-207ENST00000515742 661 ntTSL 221.02■□□□□ 0.968e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.948e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 GSTO1-204ENST00000445155 829 ntTSL 220.15■□□□□ 0.828e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.758e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 MBD6-212ENST00000552163 570 ntTSL 319.37■□□□□ 0.698e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 P2RX4-213ENST00000543430 1436 ntTSL 518.62■□□□□ 0.578e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 RFXANK-214ENST00000545522 888 ntTSL 218.54■□□□□ 0.568e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.538e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 TERT-203ENST00000460137 2992 ntTSL 1 (best)18.1■□□□□ 0.498e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.498e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 RFXANK-210ENST00000541873 1002 ntTSL 217.92■□□□□ 0.468e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.448e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 RFXANK-215ENST00000593273 865 ntTSL 317.57■□□□□ 0.48e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.398e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 P2RX4-214ENST00000543984 1612 ntTSL 217.36■□□□□ 0.378e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.358e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 KAZN-206ENST00000491547 5592 ntTSL 217.12■□□□□ 0.338e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.38e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.288e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.268e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 TBC1D9B-213ENST00000521669 592 ntTSL 216.63■□□□□ 0.258e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 RFXANK-209ENST00000540981 832 ntTSL 516.62■□□□□ 0.258e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.248e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.228e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.28e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 ARMC1-206ENST00000528721 887 ntTSL 216.12■□□□□ 0.178e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 RFXANK-212ENST00000543157 919 ntTSL 216.05■□□□□ 0.168e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 TERT-204ENST00000484238 2422 ntTSL 515.92■□□□□ 0.148e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.138e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.028e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.018e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.028e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.038e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 FBXW9-202ENST00000587296 1581 ntTSL 214.73□□□□□ -0.058e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.078e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.088e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.098e-9■■■■■ 39.1
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SF3B4Q15427 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.28e-9■■■■■ 39.1
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SF3B4Q15427 HECTD3-205ENST00000486132 2385 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.428e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.438e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 ATF6B-214ENST00000485314 1020 ntTSL 212.3□□□□□ -0.448e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 DEK-204ENST00000505224 1372 ntTSL 212.21□□□□□ -0.458e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.468e-7■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.468e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.498e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 ARMC1-201ENST00000276569 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.528e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 TKT-207ENST00000461139 1972 ntTSL 211.76□□□□□ -0.538e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 DEK-203ENST00000503715 580 ntTSL 511.72□□□□□ -0.538e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 RPS14-207ENST00000521466 592 ntAPPRIS P1 TSL 511.71□□□□□ -0.538e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 SLC22A5-206ENST00000448810 852 ntTSL 1 (best)11.63□□□□□ -0.558e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 MYH9-209ENST00000477189 572 ntTSL 211.52□□□□□ -0.578e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 HECTD3-206ENST00000486296 812 ntTSL 511.44□□□□□ -0.588e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 ATF6B-212ENST00000468502 564 ntTSL 210.99□□□□□ -0.658e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 DEPDC1-201ENST00000370966 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.668e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 TMCO3-205ENST00000465556 314 ntTSL 310.9□□□□□ -0.668e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 RPS14-204ENST00000518139 669 ntTSL 310.56□□□□□ -0.728e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 PCSK7-214ENST00000534529 5393 ntTSL 510.53□□□□□ -0.728e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.738e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 NDST2-206ENST00000465929 527 ntTSL 510.26□□□□□ -0.778e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 RPS14-202ENST00000401695 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.778e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 LCP2-210ENST00000628092 2421 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.868e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 HECTD3-203ENST00000466423 914 ntTSL 39.56□□□□□ -0.888e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 CCDC136-214ENST00000494552 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.31□□□□□ -0.928e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 SLC23A2-203ENST00000423430 911 ntTSL 59.03□□□□□ -0.962e-18■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 CCDC136-209ENST00000480137 3732 ntTSL 28.78□□□□□ -18e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 NBR1-203ENST00000585505 3295 ntTSL 28.65□□□□□ -1.028e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 P2RX4-206ENST00000538417 866 ntTSL 38.04□□□□□ -1.128e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.152e-18■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.172e-18■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 TMCO3-204ENST00000462877 491 ntTSL 27.16□□□□□ -1.268e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.418e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.458e-9■■■■■ 39.1
SF3B4Q15427 LCP2-205ENST00000520344 666 ntTSL 55.43□□□□□ -1.548e-9■■■■■ 39.1
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