Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A2Q12974 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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