Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIRE1Q08AE8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms