Protein–RNA interactions for Protein: Q07478

SUB2, ATP-dependent RNA helicase SUB2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUB2Q07478 ATP18YML081C-A 180 nt5.57□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 UBX4YMR067C 1251 nt5.57□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 PAI3YMR174C 207 nt5.57□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 FYV12YOR183W 390 nt5.57□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 AFR1YDR085C 1863 nt5.57□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 SKG3YLR187W 3081 nt5.57□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 GIP4YAL031C 2283 nt5.57□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 GDB1YPR184W 4611 nt5.56□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 MAL11YGR289C 1851 nt5.56□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 ASM4YDL088C 1587 nt5.56□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 YML096WYML096W 1578 nt5.56□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt5.56□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 PXR1YGR280C 816 nt5.56□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 YHI9YHR029C 885 nt5.56□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 RPL16AYIL133C 600 nt5.56□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 PHO86YJL117W 936 nt5.56□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 RPL15BYMR121C 615 nt5.56□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 YNL235CYNL235C 432 nt5.56□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 MSN1YOL116W 1149 nt5.56□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 YPL035CYPL035C 348 nt5.56□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 PBN1YCL052C 1251 nt5.56□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 NEL1YHR035W 1893 nt5.56□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 YDL199CYDL199C 2064 nt5.55□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 OCA5YHL029C 2040 nt5.55□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 ISW2YOR304W 3363 nt5.55□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 HAP1YLR256W 4509 nt5.55□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 YDL187CYDL187C 330 nt5.55□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 VPS74YDR372C 1038 nt5.55□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 CAX4YGR036C 720 nt5.55□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 ECM34YHL043W 513 nt5.55□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 CMS1YLR003C 876 nt5.55□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 BUR2YLR226W 1188 nt5.55□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 YLR296WYLR296W 327 nt5.55□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 ECM23YPL021W 564 nt5.55□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 DIB1YPR082C 432 nt5.55□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 GDS1YOR355W 1569 nt5.55□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 NOP6YDL213C 678 nt5.54□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 AML1YGR001C 747 nt5.54□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 GOS1YHL031C 672 nt5.54□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 YET1YKL065C 621 nt5.54□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 MRPL44YMR225C 297 nt5.54□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 IGO1YNL157W 507 nt5.54□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 EPO1YMR124W 2832 nt5.54□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 YAP1802YGR241C 1707 nt5.54□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 HUL5YGL141W 2733 nt5.54□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 HFA1YMR207C 6372 nt5.53□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 PFK1YGR240C 2964 nt5.53□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 TAF12YDR145W 1620 nt5.53□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 OAF3YKR064W 2592 nt5.53□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 snR68snR68 136 nt5.53□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 YDR340WYDR340W 303 nt5.53□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 UPF3YGR072W 1164 nt5.53□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 NFU1YKL040C 771 nt5.53□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 RPC37YKR025W 849 nt5.53□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 CPS1YJL172W 1731 nt5.53□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 VPS30YPL120W 1674 nt5.53□□□□□ -1.52
SUB2Q07478 OPT2YPR194C 2634 nt5.52□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 ULP1YPL020C 1866 nt5.52□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YDR417CYDR417C 372 nt5.52□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt5.52□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 IRC18YJL037W 675 nt5.52□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YKL070WYKL070W 510 nt5.52□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 KTI12YKL110C 942 nt5.52□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 BER1YLR412W 825 nt5.52□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt5.52□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 PHO80YOL001W 882 nt5.52□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YOR203WYOR203W 354 nt5.52□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YER077CYER077C 2067 nt5.52□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 RIM4YHL024W 2142 nt5.51□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 GRX4YER174C 735 nt5.51□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt5.51□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YHR130CYHR130C 336 nt5.51□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YHR213WYHR213W 597 nt5.51□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 RPL17BYJL177W 555 nt5.51□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YAR062WYAR062W 597 nt5.51□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YNL276CYNL276C 396 nt5.51□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 UBA1YKL210W 3075 nt5.51□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 TRP3YKL211C 1455 nt5.51□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 AEP1YMR064W 1557 nt5.5□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 ABF1YKL112W 2196 nt5.5□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 DOA1YKL213C 2148 nt5.5□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 TNA1YGR260W 1605 nt5.5□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 ALG6YOR002W 1635 nt5.5□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YDL032WYDL032W 312 nt5.5□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YER175W-AYER175W-A 165 nt5.5□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 FAR7YFR008W 666 nt5.5□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YGR228WYGR228W 345 nt5.5□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 SDH3YKL141W 597 nt5.5□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YLR400WYLR400W 474 nt5.5□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 PUB1YNL016W 1362 nt5.5□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YOR1YGR281W 4434 nt5.5□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 RNA14YMR061W 2034 nt5.5□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 ASI3YNL008C 2031 nt5.5□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 FUI1YBL042C 1920 nt5.49□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YDR114CYDR114C 303 nt5.49□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 MFA1YDR461W 111 nt5.49□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 VMA8YEL051W 771 nt5.49□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 CHZ1YER030W 462 nt5.49□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt5.49□□□□□ -1.53
SUB2Q07478 LYS5YGL154C 819 nt5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.2 ms