Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	Q05541	HCM1	YCR065W	1695 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	YPT52	YKR014C	705 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	SIW14	YNL032W	846 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	RRP36	YOR287C	903 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	SLY41	YOR307C	1362 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	CST9	YLR394W	1449 nt		4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	WHI3	YNL197C	1986 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	TCB3	YML072C	4638 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	OAF3	YKR064W	2592 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	GDE1	YPL110C	3672 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	YHL002C-A	YHL002C-A	489 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	EPT1	YHR123W	1176 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	REC102	YLR329W	795 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	ASI2	YNL159C	870 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	IST1	YNL265C	897 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	SIL1	YOL031C	1266 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	YCL002C	YCL002C	792 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	CIT1	YNR001C	1440 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	SSH1	YBR283C	1473 nt		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	BCK2	YER167W	2556 nt		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	MNN1	YER001W	2289 nt		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	UTP25	YIL091C	2166 nt		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	CIK1	YMR198W	1785 nt		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	PMI40	YER003C	1290 nt		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	GPP2	YER062C	753 nt		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	OTU1	YFL044C	906 nt		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	PTI1	YGR156W	1278 nt		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	HIS5	YIL116W	1158 nt		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	PAM18	YLR008C	507 nt		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	RPL18B	YNL301C	561 nt		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	CDC15	YAR019C	2925 nt		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	FKH2	YNL068C	2589 nt		4.84	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	AI4	Q0065	1671 nt		4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	DAP2	YHR028C	2457 nt		4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	GYP6	YJL044C	1377 nt		4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	HMO1	YDR174W	741 nt		4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	AML1	YGR001C	747 nt		4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YLR428C	YLR428C	345 nt		4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YML053C	YML053C	639 nt		4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	OSH2	YDL019C	3852 nt		4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	RAV2	YDR202C	1056 nt		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	TLG1	YDR468C	675 nt		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YER158W-A	YER158W-A	216 nt		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YGR114C	YGR114C	390 nt		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	LIN1	YHR156C	1023 nt		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	IRC18	YJL037W	675 nt		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	DGA1	YOR245C	1257 nt		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YPL135C-A	YPL135C-A	174 nt		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YCL022C	YCL022C	516 nt		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	KAR4	YCL055W	1008 nt		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	SHE9	YDR393W	1371 nt		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	DPH1	YIL103W	1278 nt		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	CAP1	YKL007W	807 nt		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YLR050C	YLR050C	486 nt		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YMR087W	YMR087W	855 nt		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YBL055C	YBL055C	1257 nt		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YPT53	YNL093W	663 nt		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	MIX23	YBL107C	591 nt		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	SGT1	YOR057W	1188 nt		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	DDP1	YOR163W	567 nt		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	HUT1	YPL244C	1020 nt		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	SRP1	YNL189W	1629 nt		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	BUD5	YCR038C	1929 nt		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YGR117C	YGR117C	1431 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	MSM1	YGR171C	1728 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	PPQ1	YPL179W	1650 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	TPA1	YER049W	1935 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	PIG2	YIL045W	1617 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	FAS2	YPL231W	5664 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	RIM1	YCR028C-A	408 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YDR340W	YDR340W	303 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	LRS4	YDR439W	1044 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	MAG1	YER142C	891 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	COX4	YGL187C	468 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	RPL27A	YHR010W	411 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YHR182C-A	YHR182C-A	474 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	SGN1	YIR001C	753 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YJL147C	YJL147C	1149 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YKL115C	YKL115C	393 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	BRX1	YOL077C	876 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YOR082C	YOR082C	342 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YPR147C	YPR147C	915 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	RXT2	YBR095C	1293 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	NUP133	YKR082W	3474 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	PHO84	YML123C	1764 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YGR125W	YGR125W	3111 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	PKP2	YGL059W	1476 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	AGE1	YDR524C	1449 nt		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	NAT1	YDL040C	2565 nt		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YDL199C	YDL199C	2064 nt		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	ESA1	YOR244W	1338 nt		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	ECM11	YDR446W	909 nt		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	MAM1	YER106W	909 nt		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YGL188C	YGL188C	174 nt		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	MRPL16	YBL038W	699 nt		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	ASC1	YMR116C	960 nt		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YPL035C	YPL035C	348 nt		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	VPS45	YGL095C	1734 nt		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	UBP8	YMR223W	1416 nt		4.79	□□□□□ -1.64
NSE3	Q05541	YFL002W-B	YFL002W-B	1317 nt		4.78	□□□□□ -1.64

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