Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS1P54277 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS1P54277 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS1P54277 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS1P54277 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS1P54277 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS1P54277 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS1P54277 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS1P54277 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS1P54277 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS1P54277 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS1P54277 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS1P54277 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS1P54277 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS1P54277 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS1P54277 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS1P54277 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS1P54277 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS1P54277 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS1P54277 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS1P54277 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS1P54277 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS1P54277 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS1P54277 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS1P54277 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS1P54277 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS1P54277 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS1P54277 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS1P54277 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS1P54277 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS1P54277 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS1P54277 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS1P54277 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS1P54277 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS1P54277 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS1P54277 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS1P54277 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS1P54277 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS1P54277 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PMS1P54277 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS1P54277 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS1P54277 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS1P54277 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms