Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 PKP2YGL059W 1476 nt3.47□□□□□ -1.85
SEC28P40509 NKP1YDR383C 717 nt3.47□□□□□ -1.85
SEC28P40509 ARI1YGL157W 1044 nt3.47□□□□□ -1.85
SEC28P40509 SPT4YGR063C 309 nt3.47□□□□□ -1.85
SEC28P40509 PAN5YHR063C 1140 nt3.47□□□□□ -1.85
SEC28P40509 SWD2YKL018W 990 nt3.47□□□□□ -1.85
SEC28P40509 DUG3YNL191W 1074 nt3.47□□□□□ -1.85
SEC28P40509 RPS7AYOR096W 573 nt3.47□□□□□ -1.85
SEC28P40509 VBA4YDR119W 2307 nt3.47□□□□□ -1.85
SEC28P40509 PSY4YBL046W 1326 nt3.46□□□□□ -1.85
SEC28P40509 RRP42YDL111C 798 nt3.46□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YDL242WYDL242W 354 nt3.46□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YGL138CYGL138C 1038 nt3.46□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YGL214WYGL214W 486 nt3.46□□□□□ -1.86
SEC28P40509 RPS25AYGR027C 327 nt3.46□□□□□ -1.86
SEC28P40509 SHH3YMR118C 591 nt3.46□□□□□ -1.86
SEC28P40509 CTL1YMR180C 963 nt3.46□□□□□ -1.86
SEC28P40509 PLP2YOR281C 861 nt3.46□□□□□ -1.86
SEC28P40509 PRM4YPL156C 855 nt3.46□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YPR053CYPR053C 456 nt3.46□□□□□ -1.86
SEC28P40509 FLO5YHR211W 3228 nt3.46□□□□□ -1.86
SEC28P40509 SLI1YGR212W 1407 nt3.45□□□□□ -1.86
SEC28P40509 NDC80YIL144W 2076 nt3.45□□□□□ -1.86
SEC28P40509 DUN1YDL101C 1542 nt3.45□□□□□ -1.86
SEC28P40509 CIN1YOR349W 3045 nt3.45□□□□□ -1.86
SEC28P40509 MNT4YNR059W 1743 nt3.45□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YHR097CYHR097C 1101 nt3.45□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YPL168WYPL168W 1293 nt3.45□□□□□ -1.86
SEC28P40509 CHS3YBR023C 3498 nt3.45□□□□□ -1.86
SEC28P40509 PRP22YER013W 3438 nt3.45□□□□□ -1.86
SEC28P40509 PFK26YIL107C 2484 nt3.45□□□□□ -1.86
SEC28P40509 ALA1YOR335C 2877 nt3.44□□□□□ -1.86
SEC28P40509 SST2YLR452C 2097 nt3.44□□□□□ -1.86
SEC28P40509 GWT1YJL091C 1473 nt3.44□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YGL152CYGL152C 678 nt3.44□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YHL026CYHL026C 948 nt3.44□□□□□ -1.86
SEC28P40509 TUM1YOR251C 915 nt3.44□□□□□ -1.86
SEC28P40509 RRP7YCL031C 894 nt3.44□□□□□ -1.86
SEC28P40509 HTA1YDR225W 399 nt3.43□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YDR535CYDR535C 501 nt3.43□□□□□ -1.86
SEC28P40509 PRP18YGR006W 756 nt3.43□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YGR114CYGR114C 390 nt3.43□□□□□ -1.86
SEC28P40509 PPE1YHR075C 1203 nt3.43□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YIL161WYIL161W 708 nt3.43□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YIR040CYIR040C 333 nt3.43□□□□□ -1.86
SEC28P40509 SOD1YJR104C 465 nt3.43□□□□□ -1.86
SEC28P40509 HOT13YKL084W 351 nt3.43□□□□□ -1.86
SEC28P40509 SKG1YKR100C 1068 nt3.43□□□□□ -1.86
SEC28P40509 COQ9YLR201C 783 nt3.43□□□□□ -1.86
SEC28P40509 RPS28BYLR264W 204 nt3.43□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YOL118CYOL118C 309 nt3.43□□□□□ -1.86
SEC28P40509 MTR4YJL050W 3222 nt3.43□□□□□ -1.86
SEC28P40509 REG1YDR028C 3045 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YCR085WYCR085W 354 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 FAP7YDL166C 594 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 RAD55YDR076W 1221 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 ECM11YDR446W 909 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YFL051CYFL051C 483 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 MPC3YGR243W 441 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 ECM4YKR076W 1113 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YBL028CYBL028C 321 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 HHF2YNL030W 312 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YNR062CYNR062C 984 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 RSC1YGR056W 2787 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YAK1YJL141C 2424 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 SPH1YLR313C 1593 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 RRP14YKL082C 1305 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 RTT109YLL002W 1311 nt3.42□□□□□ -1.86
SEC28P40509 JEN1YKL217W 1851 nt3.41□□□□□ -1.86
SEC28P40509 VPS9YML097C 1356 nt3.41□□□□□ -1.86
SEC28P40509 SMC3YJL074C 3693 nt3.41□□□□□ -1.86
SEC28P40509 ARF1YDL192W 546 nt3.41□□□□□ -1.86
SEC28P40509 SPT3YDR392W 1014 nt3.41□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YEL075CYEL075C 369 nt3.41□□□□□ -1.86
SEC28P40509 SDP1YIL113W 630 nt3.41□□□□□ -1.86
SEC28P40509 GAB1YLR459W 1185 nt3.41□□□□□ -1.86
SEC28P40509 RAD14YMR201C 1116 nt3.41□□□□□ -1.86
SEC28P40509 MCT1YOR221C 1083 nt3.41□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YBR053CYBR053C 1077 nt3.41□□□□□ -1.86
SEC28P40509 WHI3YNL197C 1986 nt3.4□□□□□ -1.86
SEC28P40509 YDL176WYDL176W 2127 nt3.4□□□□□ -1.86
SEC28P40509 ARG5,6YER069W 2592 nt3.4□□□□□ -1.86
SEC28P40509 SEM1YDR363W-A 270 nt3.4□□□□□ -1.87
SEC28P40509 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.4□□□□□ -1.87
SEC28P40509 SCM4YGR049W 564 nt3.4□□□□□ -1.87
SEC28P40509 EXO70YJL085W 1872 nt3.4□□□□□ -1.87
SEC28P40509 ATG16YMR159C 453 nt3.4□□□□□ -1.87
SEC28P40509 YNL184CYNL184C 327 nt3.4□□□□□ -1.87
SEC28P40509 POL30YBR088C 777 nt3.4□□□□□ -1.87
SEC28P40509 NUP60YAR002W 1620 nt3.4□□□□□ -1.87
SEC28P40509 LCB4YOR171C 1875 nt3.39□□□□□ -1.87
SEC28P40509 AUS1YOR011W 4185 nt3.39□□□□□ -1.87
SEC28P40509 YGR039WYGR039W 312 nt3.39□□□□□ -1.87
SEC28P40509 RIF2YLR453C 1188 nt3.39□□□□□ -1.87
SEC28P40509 OST6YML019W 999 nt3.39□□□□□ -1.87
SEC28P40509 ICS2YBR157C 768 nt3.39□□□□□ -1.87
SEC28P40509 XRN1YGL173C 4587 nt3.39□□□□□ -1.87
SEC28P40509 MSH2YOL090W 2895 nt3.38□□□□□ -1.87
SEC28P40509 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.38□□□□□ -1.87
SEC28P40509 MTC3YGL226W 372 nt3.38□□□□□ -1.87
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