Protein–RNA interactions for Protein: P38353

SSH1, Sec sixty-one protein homolog, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSH1P38353 NIP7YPL211W 546 nt2.78□□□□□ -1.96
SSH1P38353 EXO70YJL085W 1872 nt2.77□□□□□ -1.97
SSH1P38353 PCL2YDL127W 927 nt2.77□□□□□ -1.97
SSH1P38353 CLB3YDL155W 1284 nt2.77□□□□□ -1.97
SSH1P38353 BLS1YLR408C 369 nt2.77□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.77□□□□□ -1.97
SSH1P38353 COS1YNL336W 1146 nt2.77□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YOL024WYOL024W 519 nt2.77□□□□□ -1.97
SSH1P38353 POS5YPL188W 1245 nt2.77□□□□□ -1.97
SSH1P38353 PIN3YPR154W 648 nt2.77□□□□□ -1.97
SSH1P38353 CTM1YHR109W 1758 nt2.77□□□□□ -1.97
SSH1P38353 TRM1YDR120C 1713 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 AEP2YMR282C 1743 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 TAF2YCR042C 4224 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 SIN4YNL236W 2925 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YPS6YIR039C 1614 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 ADH4YGL256W 1149 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YGR026WYGR026W 837 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 SAY1YGR263C 1275 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YHL045WYHL045W 348 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 MRPL6YHR147C 645 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 NIT3YLR351C 876 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 RPN13YLR421C 471 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 CAF20YOR276W 486 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YPR203WYPR203W 309 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 PHO88YBR106W 567 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 STE6YKL209C 3873 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 BUD4YJR092W 4344 nt2.76□□□□□ -1.97
SSH1P38353 CDC40YDR364C 1368 nt2.75□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YGR237CYGR237C 2358 nt2.75□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YDL026WYDL026W 312 nt2.75□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YDR340WYDR340W 303 nt2.75□□□□□ -1.97
SSH1P38353 DDI2YFL061W 678 nt2.75□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YPT35YHR105W 645 nt2.75□□□□□ -1.97
SSH1P38353 MRPL49YJL096W 486 nt2.75□□□□□ -1.97
SSH1P38353 AIM25YJR100C 984 nt2.75□□□□□ -1.97
SSH1P38353 DID4YKL002W 699 nt2.75□□□□□ -1.97
SSH1P38353 DDI3YNL335W 678 nt2.75□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YPR078CYPR078C 1119 nt2.75□□□□□ -1.97
SSH1P38353 MET10YFR030W 3108 nt2.75□□□□□ -1.97
SSH1P38353 CHS2YBR038W 2892 nt2.75□□□□□ -1.97
SSH1P38353 NOP4YPL043W 2058 nt2.75□□□□□ -1.97
SSH1P38353 FKH2YNL068C 2589 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YCR015CYCR015C 954 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 OPI6YDL096C 327 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 RPL1BYGL135W 654 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 AML1YGR001C 747 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 POP6YGR030C 477 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 GLG2YJL137C 1143 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 AIM26YKL037W 357 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 REC102YLR329W 795 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 MDJ2YNL328C 441 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YNR068CYNR068C 819 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 RAS1YOR101W 930 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 SUR1YPL057C 1149 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 RPL1AYPL220W 654 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 ITC1YGL133W 3795 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 VBA4YDR119W 2307 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 PLM2YDR501W 1566 nt2.74□□□□□ -1.97
SSH1P38353 SRB8YCR081W 4284 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 FMP32YFL046W 624 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YFL051CYFL051C 483 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 CPR7YJR032W 1182 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 RPC37YKR025W 849 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 PBA1YLR199C 831 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YPR027CYPR027C 834 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 CHO2YGR157W 2610 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 SNQ2YDR011W 4506 nt2.73□□□□□ -1.97
SSH1P38353 AEP3YPL005W 1821 nt2.72□□□□□ -1.97
SSH1P38353 ADY4YLR227C 1482 nt2.72□□□□□ -1.97
SSH1P38353 CLN2YPL256C 1638 nt2.72□□□□□ -1.97
SSH1P38353 DYN1YKR054C 12279 nt2.72□□□□□ -1.97
SSH1P38353 TGL2YDR058C 981 nt2.72□□□□□ -1.97
SSH1P38353 PDC2YDR081C 2778 nt2.72□□□□□ -1.97
SSH1P38353 IZH1YDR492W 951 nt2.72□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YIL175WYIL175W 318 nt2.72□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YIR014WYIR014W 729 nt2.72□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.72□□□□□ -1.97
SSH1P38353 SSN8YNL025C 972 nt2.72□□□□□ -1.97
SSH1P38353 DBP5YOR046C 1449 nt2.72□□□□□ -1.97
SSH1P38353 YBR089WYBR089W 600 nt2.72□□□□□ -1.97
SSH1P38353 PSK1YAL017W 4071 nt2.72□□□□□ -1.97
SSH1P38353 STE24YJR117W 1362 nt2.72□□□□□ -1.97
SSH1P38353 CBP2YHL038C 1893 nt2.71□□□□□ -1.98
SSH1P38353 TOM70YNL121C 1854 nt2.71□□□□□ -1.98
SSH1P38353 ALG8YOR067C 1734 nt2.71□□□□□ -1.98
SSH1P38353 BSC2YDR275W 708 nt2.71□□□□□ -1.98
SSH1P38353 APA2YDR530C 978 nt2.71□□□□□ -1.98
SSH1P38353 SCM4YGR049W 564 nt2.71□□□□□ -1.98
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