Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGM1P36871 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGM1P36871 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGM1P36871 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGM1P36871 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGM1P36871 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGM1P36871 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGM1P36871 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGM1P36871 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGM1P36871 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGM1P36871 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGM1P36871 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGM1P36871 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGM1P36871 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGM1P36871 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGM1P36871 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGM1P36871 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGM1P36871 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGM1P36871 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGM1P36871 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGM1P36871 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGM1P36871 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGM1P36871 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGM1P36871 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGM1P36871 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PGM1P36871 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PGM1P36871 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGM1P36871 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGM1P36871 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGM1P36871 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PGM1P36871 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PGM1P36871 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PGM1P36871 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PGM1P36871 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PGM1P36871 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGM1P36871 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGM1P36871 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGM1P36871 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGM1P36871 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGM1P36871 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PGM1P36871 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGM1P36871 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGM1P36871 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PGM1P36871 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGM1P36871 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGM1P36871 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGM1P36871 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGM1P36871 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGM1P36871 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PGM1P36871 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PGM1P36871 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PGM1P36871 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGM1P36871 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGM1P36871 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGM1P36871 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGM1P36871 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGM1P36871 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PGM1P36871 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms