Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH5P33151 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH5P33151 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH5P33151 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH5P33151 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH5P33151 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH5P33151 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH5P33151 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH5P33151 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH5P33151 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH5P33151 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH5P33151 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH5P33151 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH5P33151 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH5P33151 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH5P33151 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH5P33151 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH5P33151 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH5P33151 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH5P33151 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH5P33151 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH5P33151 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDH5P33151 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDH5P33151 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH5P33151 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH5P33151 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH5P33151 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH5P33151 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH5P33151 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH5P33151 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH5P33151 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH5P33151 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH5P33151 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH5P33151 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH5P33151 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH5P33151 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH5P33151 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH5P33151 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH5P33151 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH5P33151 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH5P33151 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH5P33151 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH5P33151 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH5P33151 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH5P33151 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH5P33151 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH5P33151 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH5P33151 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH5P33151 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH5P33151 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH5P33151 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH5P33151 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH5P33151 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH5P33151 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH5P33151 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH5P33151 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH5P33151 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH5P33151 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH5P33151 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH5P33151 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH5P33151 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH5P33151 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH5P33151 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH5P33151 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH5P33151 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH5P33151 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH5P33151 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH5P33151 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH5P33151 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH5P33151 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH5P33151 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH5P33151 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH5P33151 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH5P33151 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH5P33151 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH5P33151 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH5P33151 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH5P33151 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH5P33151 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH5P33151 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH5P33151 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH5P33151 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH5P33151 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH5P33151 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH5P33151 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH5P33151 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH5P33151 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH5P33151 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH5P33151 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH5P33151 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms