Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPO95166 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPO95166 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms