Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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RABGEF1Q9UJ41 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABGEF1Q9UJ41 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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