Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASS4Q9NQ75 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms