Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NXNL1Q96CM4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXNL1Q96CM4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXNL1Q96CM4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXNL1Q96CM4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXNL1Q96CM4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NXNL1Q96CM4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NXNL1Q96CM4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NXNL1Q96CM4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NXNL1Q96CM4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NXNL1Q96CM4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms