Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR53Q7Z5U6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms