Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRSAM1Q6UWE0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRSAM1Q6UWE0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms