Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRKQ15262 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRKQ15262 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
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