Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
EEA1Q15075 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
EEA1Q15075 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
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