Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC63Q05C16 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC63Q05C16 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms