Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms