Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKN2BP42772 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms