Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD10P28358 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD10P28358 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms