Protein–RNA interactions for Protein: P04155

TFF1, Trefoil factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF1P04155 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TFF1P04155 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF1P04155 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF1P04155 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF1P04155 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF1P04155 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF1P04155 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TFF1P04155 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF1P04155 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF1P04155 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF1P04155 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF1P04155 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF1P04155 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF1P04155 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFF1P04155 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF1P04155 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF1P04155 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF1P04155 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF1P04155 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF1P04155 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF1P04155 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF1P04155 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF1P04155 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF1P04155 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF1P04155 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF1P04155 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF1P04155 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF1P04155 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF1P04155 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF1P04155 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF1P04155 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF1P04155 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF1P04155 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF1P04155 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF1P04155 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF1P04155 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF1P04155 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF1P04155 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF1P04155 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF1P04155 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF1P04155 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF1P04155 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF1P04155 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF1P04155 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF1P04155 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF1P04155 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF1P04155 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF1P04155 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF1P04155 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF1P04155 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF1P04155 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF1P04155 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF1P04155 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF1P04155 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF1P04155 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF1P04155 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF1P04155 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF1P04155 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF1P04155 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF1P04155 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF1P04155 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF1P04155 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF1P04155 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms