Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
C6orf47O95873 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms