Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4BP1O75113 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms