Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms