Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DFFAO00273 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DFFAO00273 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DFFAO00273 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DFFAO00273 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DFFAO00273 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DFFAO00273 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DFFAO00273 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DFFAO00273 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DFFAO00273 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DFFAO00273 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DFFAO00273 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DFFAO00273 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DFFAO00273 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DFFAO00273 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DFFAO00273 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DFFAO00273 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DFFAO00273 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DFFAO00273 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DFFAO00273 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DFFAO00273 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DFFAO00273 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DFFAO00273 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DFFAO00273 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DFFAO00273 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DFFAO00273 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DFFAO00273 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DFFAO00273 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DFFAO00273 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DFFAO00273 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DFFAO00273 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DFFAO00273 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DFFAO00273 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DFFAO00273 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DFFAO00273 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DFFAO00273 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DFFAO00273 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DFFAO00273 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DFFAO00273 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DFFAO00273 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DFFAO00273 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DFFAO00273 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DFFAO00273 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DFFAO00273 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DFFAO00273 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DFFAO00273 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DFFAO00273 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DFFAO00273 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DFFAO00273 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DFFAO00273 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DFFAO00273 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DFFAO00273 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DFFAO00273 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DFFAO00273 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DFFAO00273 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DFFAO00273 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DFFAO00273 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DFFAO00273 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DFFAO00273 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DFFAO00273 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DFFAO00273 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DFFAO00273 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DFFAO00273 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms