Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
J3KRW8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KRW8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KRW8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KRW8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KRW8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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