Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLF12Q9Y4X4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms