Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHA12Q9UN75 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA12Q9UN75 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms