Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD3Q9UJU5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms