Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1QTNF1Q9BXJ1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF1Q9BXJ1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF1Q9BXJ1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF1Q9BXJ1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF1Q9BXJ1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF1Q9BXJ1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF1Q9BXJ1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms