Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAPLN3Q96S86 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
HAPLN3Q96S86 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAPLN3Q96S86 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms