Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC82Q8N4S0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms