Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
PPARGC1BQ86YN6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms