Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BHLHA9Q7RTU4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHLHA9Q7RTU4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHA9Q7RTU4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms