Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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