Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms