Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTP4A2Q12974 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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