Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 VAC7YNL054W 3498 nt3.94□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 CTF13YMR094W 1437 nt3.94□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 PMS1YNL082W 2622 nt3.93□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 PET100YDR079W 336 nt3.93□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 SLX8YER116C 825 nt3.93□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YGL204CYGL204C 306 nt3.93□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 HTA2YBL003C 399 nt3.93□□□□□ -1.78 RIP-Chip
PUF2Q12221 YLR379WYLR379W 375 nt3.93□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 MCM1YMR043W 861 nt3.93□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 NUP133YKR082W 3474 nt3.93□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 UBP6YFR010W 1500 nt3.93□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 MEF1YLR069C 2286 nt3.92□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 MAL12YGR292W 1755 nt3.92□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 MAL32YBR299W 1755 nt3.92□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt3.92□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 OAR1YKL055C 837 nt3.92□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.92□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 PNG1YPL096W 1092 nt3.92□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YOL153CYOL153C 1746 nt3.92□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 MIG1YGL035C 1515 nt3.91□□□□□ -1.78 RIP-Chip
PUF2Q12221 HAP4YKL109W 1665 nt3.91□□□□□ -1.78 RIP-Chip
PUF2Q12221 FAA1YOR317W 2103 nt3.91□□□□□ -1.78 RIP-Chip
PUF2Q12221 YCR007CYCR007C 720 nt3.91□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 HTB1YDR224C 396 nt3.91□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 PIR3YKL163W 978 nt3.91□□□□□ -1.78 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPT6YLR262C 648 nt3.91□□□□□ -1.78 RIP-Chip
PUF2Q12221 YML047W-AYML047W-A 366 nt3.91□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YMR099CYMR099C 894 nt3.91□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 ASI2YNL159C 870 nt3.91□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt3.91□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 PWR1PWR1 941 nt3.91□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 OPY1YBR129C 987 nt3.91□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 UTP5YDR398W 1932 nt3.91□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YNL011CYNL011C 1335 nt3.91□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 HCM1YCR065W 1695 nt3.9□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 CLG1YGL215W 1359 nt3.9□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YIG1YPL201C 1386 nt3.9□□□□□ -1.78
PUF2Q12221 YCL075WYCL075W 441 nt3.9□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 ATC1YDR184C 885 nt3.9□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 COS12YGL263W 1143 nt3.9□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 SCEIQ0160 708 nt3.9□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt3.9□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt3.9□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 CKA1YIL035C 1119 nt3.9□□□□□ -1.79 RIP-Chip
PUF2Q12221 ATG38YLR211C 681 nt3.9□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YAR069CYAR069C 294 nt3.9□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YGK3YOL128C 1128 nt3.9□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YAR1YPL239W 603 nt3.9□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 REF2YDR195W 1602 nt3.9□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YCF1YDR135C 4548 nt3.9□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 MRS2YOR334W 1413 nt3.89□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 TCO89YPL180W 2400 nt3.89□□□□□ -1.79 RIP-Chip
PUF2Q12221 RPP1AYDL081C 321 nt3.89□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 NRG1YDR043C 696 nt3.89□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt3.89□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.89□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 TOS8YGL096W 831 nt3.89□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 OST5YGL226C-A 261 nt3.89□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 DPH1YIL103W 1278 nt3.89□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 ISA1YLL027W 753 nt3.89□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 HMX1YLR205C 954 nt3.89□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 NRK1YNL129W 723 nt3.89□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YOR283WYOR283W 693 nt3.89□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 GLO3YER122C 1482 nt3.89□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 HMG1YML075C 3165 nt3.89□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 MTC4YBR255W 2085 nt3.88□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 CTR86YCR054C 1692 nt3.88□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 PDS1YDR113C 1122 nt3.88□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 ATP5YDR298C 639 nt3.88□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YGR226CYGR226C 210 nt3.88□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 PRP21YJL203W 843 nt3.88□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YKL202WYKL202W 582 nt3.88□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 SWC7YLR385C 399 nt3.88□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 SAM37YMR060C 984 nt3.88□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 TMC1YOR052C 453 nt3.88□□□□□ -1.79 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOR238WYOR238W 912 nt3.88□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 FSH3YOR280C 801 nt3.88□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 FIG1YBR040W 897 nt3.88□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 HUT1YPL244C 1020 nt3.88□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YCL007CYCL007C 393 nt3.88□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 RAD1YPL022W 3303 nt3.88□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 SNU23YDL098C 585 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 RPL35BYDL136W 363 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 CRD1YDL142C 852 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 RPS11AYDR025W 471 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 TLG1YDR468C 675 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 IES6YEL044W 501 nt3.87□□□□□ -1.79 RIP-Chip
PUF2Q12221 YGL132WYGL132W 336 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 PEX18YHR160C 852 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 PPX1YHR201C 1194 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 GVP36YIL041W 981 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 CPR7YJR032W 1182 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 SYC1YOR179C 567 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 FDH2YPL275W 711 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 SMP3YOR149C 1551 nt3.87□□□□□ -1.79 RIP-Chip
PUF2Q12221 ULS1YOR191W 4860 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 DHR2YKL078W 2208 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 BCK2YER167W 2556 nt3.87□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 AGA1YNR044W 2178 nt3.86□□□□□ -1.79
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