Protein–RNA interactions for Protein: P53438

SOK2, Protein SOK2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK2P53438 VPS51YKR020W 495 nt5.1□□□□□ -1.59
SOK2P53438 YAF9YNL107W 681 nt5.1□□□□□ -1.59
SOK2P53438 GRX7YBR014C 612 nt5.1□□□□□ -1.59
SOK2P53438 DSS1YMR287C 2910 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 YCR013CYCR013C 648 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 RXT3YDL076C 885 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 SEC20YDR498C 1152 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 DBP8YHR169W 1296 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 PHO86YJL117W 936 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 HIT1YJR055W 495 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 ATP18YML081C-A 180 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 MCM1YMR043W 861 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 MCK1YNL307C 1128 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 CAM1YPL048W 1248 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 ROX1YPR065W 1107 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 FLC3YGL139W 2409 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 TSR1YDL060W 2367 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 DBF4YDR052C 2115 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 SSK1YLR006C 2139 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 QDR3YBR043C 2070 nt5.09□□□□□ -1.59
SOK2P53438 APE3YBR286W 1614 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 FRE3YOR381W 2136 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 TRM12YML005W 1389 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YCR007CYCR007C 720 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 HMRA2YCR096C 360 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 SWF1YDR126W 1011 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 RPA14YDR156W 414 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 CHZ1YER030W 462 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YER175W-AYER175W-A 165 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 CDC43YGL155W 1131 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YKL107WYKL107W 930 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 RPA49YNL248C 1248 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YNL337WYNL337W 255 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 MSS18YPR134W 807 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YBR090CYBR090C 369 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YBR285WYBR285W 435 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 FOB1YDR110W 1701 nt5.08□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YPL109CYPL109C 1974 nt5.07□□□□□ -1.6
SOK2P53438 NEL1YHR035W 1893 nt5.07□□□□□ -1.6
SOK2P53438 ARB1YER036C 1833 nt5.07□□□□□ -1.6
SOK2P53438 RPS25AYGR027C 327 nt5.07□□□□□ -1.6
SOK2P53438 SDL1YIL167W 633 nt5.07□□□□□ -1.6
SOK2P53438 ENT3YJR125C 1227 nt5.07□□□□□ -1.6
SOK2P53438 PBA1YLR199C 831 nt5.07□□□□□ -1.6
SOK2P53438 TRM112YNR046W 408 nt5.07□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.07□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YOR186WYOR186W 435 nt5.07□□□□□ -1.6
SOK2P53438 VPS69YPR087W 321 nt5.07□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YPR098CYPR098C 486 nt5.07□□□□□ -1.6
SOK2P53438 HCM1YCR065W 1695 nt5.07□□□□□ -1.6
SOK2P53438 ADY4YLR227C 1482 nt5.07□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YDR109CYDR109C 2148 nt5.06□□□□□ -1.6
SOK2P53438 AMD1YML035C 2433 nt5.06□□□□□ -1.6
SOK2P53438 KRE2YDR483W 1329 nt5.06□□□□□ -1.6
SOK2P53438 RTT109YLL002W 1311 nt5.06□□□□□ -1.6
SOK2P53438 SMB1YER029C 591 nt5.06□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YGL015CYGL015C 393 nt5.06□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YIL060WYIL060W 435 nt5.06□□□□□ -1.6
SOK2P53438 MAM33YIL070C 801 nt5.06□□□□□ -1.6
SOK2P53438 PAN6YIL145C 930 nt5.06□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt5.06□□□□□ -1.6
SOK2P53438 RPA43YOR340C 981 nt5.06□□□□□ -1.6
SOK2P53438 INA17YPL099C 549 nt5.06□□□□□ -1.6
SOK2P53438 CAB3YKL088W 1716 nt5.06□□□□□ -1.6
SOK2P53438 GEM1YAL048C 1989 nt5.05□□□□□ -1.6
SOK2P53438 PSY4YBL046W 1326 nt5.05□□□□□ -1.6
SOK2P53438 RSM24YDR175C 960 nt5.05□□□□□ -1.6
SOK2P53438 PEX4YGR133W 552 nt5.05□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YHR097CYHR097C 1101 nt5.05□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YJL169WYJL169W 369 nt5.05□□□□□ -1.6
SOK2P53438 SSP120YLR250W 705 nt5.05□□□□□ -1.6
SOK2P53438 RPS9AYPL081W 594 nt5.05□□□□□ -1.6
SOK2P53438 TPK2YPL203W 1143 nt5.05□□□□□ -1.6
SOK2P53438 MCM16YPR046W 546 nt5.05□□□□□ -1.6
SOK2P53438 BUD7YOR299W 2241 nt5.05□□□□□ -1.6
SOK2P53438 RFT1YBL020W 1725 nt5.05□□□□□ -1.6
SOK2P53438 RKM3YBR030W 1659 nt5.05□□□□□ -1.6
SOK2P53438 EIS1YMR031C 2532 nt5.04□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.04□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YER135CYER135C 393 nt5.04□□□□□ -1.6
SOK2P53438 MCR1YKL150W 909 nt5.04□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YMR141CYMR141C 309 nt5.04□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YBL055CYBL055C 1257 nt5.04□□□□□ -1.6
SOK2P53438 MRM1YOR201C 1239 nt5.04□□□□□ -1.6
SOK2P53438 HSP82YPL240C 2130 nt5.04□□□□□ -1.6
SOK2P53438 ICY2YPL250C 411 nt5.04□□□□□ -1.6
SOK2P53438 snR32snR32 188 nt5.04□□□□□ -1.6
SOK2P53438 SSZ1YHR064C 1617 nt5.04□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YKR078WYKR078W 1758 nt5.04□□□□□ -1.6
SOK2P53438 ARG4YHR018C 1392 nt5.04□□□□□ -1.6
SOK2P53438 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.03□□□□□ -1.6
SOK2P53438 PPN1YDR452W 2025 nt5.03□□□□□ -1.6
SOK2P53438 snR8snR8 190 nt5.03□□□□□ -1.6
SOK2P53438 YGR228WYGR228W 345 nt5.03□□□□□ -1.6
SOK2P53438 TPK3YKL166C 1197 nt5.03□□□□□ -1.6
SOK2P53438 COQ10YOL008W 624 nt5.03□□□□□ -1.6
SOK2P53438 SUE1YPR151C 621 nt5.03□□□□□ -1.6
SOK2P53438 snR24snR24 89 nt5.03□□□□□ -1.6
SOK2P53438 CIT1YNR001C 1440 nt5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 70.7 ms