Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5A1P25705 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5A1P25705 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1131.2 ms