Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
USP19O94966 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP19O94966 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP19O94966 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP19O94966 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
USP19O94966 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP19O94966 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP19O94966 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP19O94966 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP19O94966 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP19O94966 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP19O94966 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP19O94966 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP19O94966 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP19O94966 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP19O94966 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
USP19O94966 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP19O94966 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP19O94966 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP19O94966 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP19O94966 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP19O94966 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP19O94966 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP19O94966 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP19O94966 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP19O94966 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP19O94966 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP19O94966 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP19O94966 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP19O94966 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP19O94966 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP19O94966 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP19O94966 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP19O94966 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP19O94966 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP19O94966 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP19O94966 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP19O94966 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP19O94966 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP19O94966 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP19O94966 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP19O94966 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP19O94966 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP19O94966 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP19O94966 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP19O94966 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP19O94966 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP19O94966 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP19O94966 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP19O94966 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
USP19O94966 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP19O94966 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP19O94966 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP19O94966 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP19O94966 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP19O94966 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP19O94966 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP19O94966 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP19O94966 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP19O94966 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP19O94966 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP19O94966 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
USP19O94966 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
USP19O94966 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP19O94966 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP19O94966 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP19O94966 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP19O94966 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP19O94966 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP19O94966 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USP19O94966 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USP19O94966 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP19O94966 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP19O94966 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP19O94966 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
USP19O94966 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP19O94966 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP19O94966 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP19O94966 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP19O94966 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP19O94966 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP19O94966 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP19O94966 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP19O94966 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP19O94966 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP19O94966 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP19O94966 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
USP19O94966 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP19O94966 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP19O94966 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP19O94966 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP19O94966 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP19O94966 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP19O94966 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP19O94966 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP19O94966 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP19O94966 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
USP19O94966 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP19O94966 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
USP19O94966 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms